学校创办于1977年6月,最初为福建省莆田地区师范学校福清分校,后更名为福建省莆田地区师范大专班。1978年12月,经国务院批准建立福建省莆田师范专科学校,学校成为福建省首批恢复和增设的4所师范高等专科学校之一。建校初期,为培养当时社会急需的中学师资,还曾在福清、莆田、仙游、长乐、永泰、闽清等地开设分班。因校址设在福清,1980年7月,福建省政府决定将学校更名为福清师范专科学校。因省内行政区划的调整,1983年8月,福建省政府决定将学校挂靠到福建师范大学,成为福建师大二部。1984年6月,福建省政府决定将学校定名为福建师范大学福清分校,并沿用至今。 2019年底,教师辅导员进行为期一天的水果嘉年华素质拓展主题团建活动。